MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013205	GC	3	6	43733	43738	0 %	0 %	50 %	50 %	258510050
1002	NC_013205	CGA	2	6	43754	43759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510050
1003	NC_013205	AGA	2	6	43763	43768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510050
1004	NC_013205	CAGC	2	8	43776	43783	25 %	0 %	25 %	50 %	258510050
1005	NC_013205	ACCC	2	8	43806	43813	25 %	0 %	0 %	75 %	258510050
1006	NC_013205	CCG	3	9	43817	43825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510050
1007	NC_013205	GAT	3	9	43902	43910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510050
1008	NC_013205	GCC	2	6	44011	44016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510050
1009	NC_013205	CGATGG	2	12	44030	44041	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	258510050
1010	NC_013205	CCA	2	6	44042	44047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510050
1011	NC_013205	CG	3	6	44105	44110	0 %	0 %	50 %	50 %	258510051
1012	NC_013205	TCA	2	6	44119	44124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510051
1013	NC_013205	GCT	2	6	44134	44139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510051
1014	NC_013205	CG	3	6	44140	44145	0 %	0 %	50 %	50 %	258510051
1015	NC_013205	CAC	2	6	44162	44167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510051
1016	NC_013205	CGA	2	6	44170	44175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510051
1017	NC_013205	GCGAT	2	10	44196	44205	20 %	20 %	40 %	20 %	258510051
1018	NC_013205	AGC	2	6	44244	44249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510051
1019	NC_013205	GCCTT	2	10	44253	44262	0 %	40 %	20 %	40 %	258510051
1020	NC_013205	GCC	2	6	44396	44401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510051
1021	NC_013205	CGGG	2	8	44431	44438	0 %	0 %	75 %	25 %	258510051
1022	NC_013205	GCCGC	2	10	44501	44510	0 %	0 %	40 %	60 %	258510051
1023	NC_013205	CGG	2	6	44516	44521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510051
1024	NC_013205	ATG	2	6	44541	44546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510051
1025	NC_013205	GA	3	6	44565	44570	50 %	0 %	50 %	0 %	258510051
1026	NC_013205	GTCCG	2	10	44622	44631	0 %	20 %	40 %	40 %	258510051
1027	NC_013205	CCCG	2	8	44653	44660	0 %	0 %	25 %	75 %	258510051
1028	NC_013205	CTGCC	2	10	44672	44681	0 %	20 %	20 %	60 %	258510051
1029	NC_013205	CG	3	6	44684	44689	0 %	0 %	50 %	50 %	258510051
1030	NC_013205	CGC	2	6	44761	44766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510051
1031	NC_013205	CCG	2	6	44809	44814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510051
1032	NC_013205	GGC	2	6	44865	44870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510051
1033	NC_013205	GCG	2	6	44923	44928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510051
1034	NC_013205	TTTCG	2	10	44936	44945	0 %	60 %	20 %	20 %	258510051
1035	NC_013205	CG	3	6	44966	44971	0 %	0 %	50 %	50 %	258510051
1036	NC_013205	TGA	2	6	45022	45027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510051
1037	NC_013205	GC	3	6	45055	45060	0 %	0 %	50 %	50 %	258510051
1038	NC_013205	GAT	2	6	45062	45067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510051
1039	NC_013205	AAC	2	6	45072	45077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510051
1040	NC_013205	GAG	2	6	45098	45103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510051
1041	NC_013205	CG	3	6	45130	45135	0 %	0 %	50 %	50 %	258510051
1042	NC_013205	GCT	2	6	45169	45174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510051
1043	NC_013205	CGG	2	6	45267	45272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510051
1044	NC_013205	GCCC	2	8	45283	45290	0 %	0 %	25 %	75 %	258510051
1045	NC_013205	TCG	2	6	45294	45299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510051
1046	NC_013205	GAC	2	6	45305	45310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510051
1047	NC_013205	ATGCCG	2	12	45360	45371	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258510051
1048	NC_013205	CG	3	6	45385	45390	0 %	0 %	50 %	50 %	258510051
1049	NC_013205	TCA	2	6	45466	45471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510051
1050	NC_013205	T	6	6	45572	45577	0 %	100 %	0 %	0 %	258510051
1051	NC_013205	GCG	2	6	45652	45657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_013205	CG	3	6	45656	45661	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_013205	GCC	2	6	45667	45672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_013205	CCG	2	6	45676	45681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1055	NC_013205	CGTC	2	8	45751	45758	0 %	25 %	25 %	50 %	258510052
1056	NC_013205	GCG	2	6	45784	45789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510052
1057	NC_013205	GTT	2	6	45803	45808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510052
1058	NC_013205	CGC	2	6	45829	45834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510052
1059	NC_013205	TGA	2	6	45907	45912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510052
1060	NC_013205	GCC	2	6	46004	46009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510052
1061	NC_013205	GAT	2	6	46022	46027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510052
1062	NC_013205	CGC	2	6	46070	46075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510052
1063	NC_013205	CTG	2	6	46142	46147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510052
1064	NC_013205	CGG	2	6	46172	46177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510052
1065	NC_013205	TTC	2	6	46224	46229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510052
1066	NC_013205	AGA	2	6	46230	46235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510052
1067	NC_013205	CTG	2	6	46283	46288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510052
1068	NC_013205	TCG	2	6	46335	46340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510052
1069	NC_013205	ATG	2	6	46341	46346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510052
1070	NC_013205	TTG	2	6	46379	46384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510052
1071	NC_013205	GAC	2	6	46487	46492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510052
1072	NC_013205	CCT	2	6	46525	46530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510052
1073	NC_013205	GGT	2	6	46549	46554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510052
1074	NC_013205	TGT	2	6	46561	46566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510052
1075	NC_013205	GCC	2	6	46574	46579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510052
1076	NC_013205	TCG	2	6	46618	46623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510052
1077	NC_013205	GGT	2	6	46625	46630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510052
1078	NC_013205	TGC	2	6	46639	46644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510052
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1080	NC_013205	CGA	2	6	46670	46675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510052
1081	NC_013205	GTT	2	6	46676	46681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510052
1082	NC_013205	ACG	2	6	46695	46700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510052
1083	NC_013205	GCGGCC	2	12	46704	46715	0 %	0 %	50 %	50 %	258510052
1084	NC_013205	CGA	2	6	46852	46857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_013205	ATG	2	6	46997	47002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_013205	TGA	2	6	47007	47012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_013205	CGG	2	6	47025	47030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_013205	AAAC	2	8	47081	47088	75 %	0 %	0 %	25 %	258510053
1089	NC_013205	AGG	2	6	47166	47171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510053
1090	NC_013205	GC	3	6	47183	47188	0 %	0 %	50 %	50 %	258510053
1091	NC_013205	CAA	2	6	47257	47262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510053
1092	NC_013205	GGCG	2	8	47344	47351	0 %	0 %	75 %	25 %	258510053
1093	NC_013205	GGT	2	6	47356	47361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510053
1094	NC_013205	GCA	2	6	47391	47396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510053
1095	NC_013205	GC	3	6	47413	47418	0 %	0 %	50 %	50 %	258510053
1096	NC_013205	GTG	2	6	47465	47470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510053
1097	NC_013205	GGC	2	6	47488	47493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510053
1098	NC_013205	GCCT	2	8	47528	47535	0 %	25 %	25 %	50 %	258510053
1099	NC_013205	GAG	2	6	47609	47614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510053
1100	NC_013205	AGCTAC	2	12	47699	47710	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	258510054
1101	NC_013205	CGA	2	6	47722	47727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510054
1102	NC_013205	GGGC	2	8	47756	47763	0 %	0 %	75 %	25 %	258510054
1103	NC_013205	CG	3	6	47957	47962	0 %	0 %	50 %	50 %	258510054
1104	NC_013205	CG	3	6	48002	48007	0 %	0 %	50 %	50 %	258510054
1105	NC_013205	GGC	2	6	48029	48034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510054
1106	NC_013205	GGT	2	6	48040	48045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510054
1107	NC_013205	CG	4	8	48085	48092	0 %	0 %	50 %	50 %	258510054
1108	NC_013205	GAA	2	6	48139	48144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510054
1109	NC_013205	TCCT	2	8	48152	48159	0 %	50 %	0 %	50 %	258510054
1110	NC_013205	GGC	2	6	48172	48177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510054
1111	NC_013205	TCGC	2	8	48188	48195	0 %	25 %	25 %	50 %	258510054
1112	NC_013205	GCT	2	6	48274	48279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510054
1113	NC_013205	AGT	2	6	48282	48287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510054
1114	NC_013205	AGGCG	2	10	48308	48317	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1115	NC_013205	CG	3	6	48393	48398	0 %	0 %	50 %	50 %	258510055
1116	NC_013205	AGCGG	2	10	48410	48419	20 %	0 %	60 %	20 %	258510055
1117	NC_013205	GAC	2	6	48445	48450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510055
1118	NC_013205	CA	3	6	48465	48470	50 %	0 %	0 %	50 %	258510055
1119	NC_013205	CGC	2	6	48477	48482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510055
1120	NC_013205	AGA	2	6	48501	48506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510055
1121	NC_013205	GC	3	6	48544	48549	0 %	0 %	50 %	50 %	258510055
1122	NC_013205	CAC	2	6	48550	48555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510055
1123	NC_013205	CCT	2	6	48642	48647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510055
1124	NC_013205	AGGA	2	8	48650	48657	50 %	0 %	50 %	0 %	258510055
1125	NC_013205	CTC	2	6	48667	48672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510055
1126	NC_013205	AGG	2	6	48826	48831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_013205	TCG	2	6	48876	48881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510056
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1235	NC_013205	CCGCA	2	10	53734	53743	20 %	0 %	20 %	60 %	258510061
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1247	NC_013205	GAG	2	6	54151	54156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510061
1248	NC_013205	GAC	2	6	54250	54255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510061
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1253	NC_013205	TCG	2	6	54529	54534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510062
1254	NC_013205	GCCG	2	8	54618	54625	0 %	0 %	50 %	50 %	258510062
1255	NC_013205	ACG	2	6	54652	54657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510062
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1258	NC_013205	TCC	2	6	54757	54762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510062
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1263	NC_013205	CGATT	2	10	54860	54869	20 %	40 %	20 %	20 %	258510062
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1282	NC_013205	CCGT	2	8	55611	55618	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1283	NC_013205	TGA	2	6	55667	55672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1489	NC_013205	CCCA	2	8	64366	64373	25 %	0 %	0 %	75 %	258510070
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1492	NC_013205	GCG	2	6	64469	64474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510070
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1498	NC_013205	CAA	2	6	64705	64710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510070
1499	NC_013205	GAT	2	6	64771	64776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510070
1500	NC_013205	GTG	2	6	64817	64822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510070

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